Gümrük Uzmanlığı, Gümrük Birliği ve Avrupa Birliği ile uyum çalışmaları sürecinde ortaya çıkan uzman personel ihtiyacını karşılamak üzere 1995 yılında ihdas edilen bir kariyer mesleğidir.

Türk Gümrüklerinin kurumsal yapısında reforma gidilerek “Gümrük İdaresinin Modernizasyonu Projesi”nin gerçekleştirilmesi amacıyla 1995 yılında Dünya Bankası ile bir kredi anlaşması imzalanmış, projenin önemli bir boyutu olarak insan kaynakları yapısının da iyileştirilmesi amacıyla Başbakanlığa bağlı Gümrük Müsteşarlığı bünyesinde Gümrük Uzmanı istihdamı gündeme gelmiştir. 

İlk Gümrük Uzman Yardımcıları, Türkiye ile Avrupa Birliği arasında tesis edilen Gümrük Birliğinin hayata geçtiği tarihte, Ocak 1996'da göreve başlamıştır.